18歳未満を淫行行為などから保護するため、都道府県条令があります。それは、親子関係であっても例外ではありません。しかし、被害者からの訴えから逮捕、起訴されるのが普通なので、両者合意で、訴えがない限り逮捕はないでしょう。ただ、違法であることには変わりがないので、社会問題などに発展すれば、逮捕もありえます。罰は、条令により（都道府県により）異なります。
奥様と息子さんとの間に子供ができても犯罪にはなりません。そんな場合、奥様のご主人、つまりあなたの子供とすることが多いと思いますが、本当は虚偽の申告ですから、違法です。しかし、これも取り締まりが困難ですから、野放し状態と言えます。正直にするには、息子さんとの間の子として届出をし、息子さんが自分の子として認知することです。ただ、息子さんは未成年なので親権者の同意などが必要なはずです。
しかし、現実は違法な方法を選択するのが、普通でしょう。
　日本の法や行政の姿勢は、現実を直視せず、形式を重視、つまり形だけ整っていれば、通過してしまう体質をもっているような気が私はします。