少なくとも、肉体的な女性化をしようと思うと、女性ホルモンの接種が必要になりますが
それをすると男性機能は確実に失われますので、子供は作れなくなります。

肉体的女性化、子供、どちらも手に入れたいのであれば、早急に子供を作り、その後で
女性化に着手するしかないと思います。

男性側は40代ならまだまだ子作りは可能ですが、女性は40代になると胎児に異常が出るリスクが
高くなるので早めの決断をされたほうがいいのではないでしょうか？

ただその場合でも、将来的に「お母さんが二人・お父さんはいない」状態になるので、
彼女の理解は不可欠ですけれど。